Z uwagi na osłabienie funkcji układu odpornościowego związane z nasiloną niewydolnością nerek zaleca się, aby szczepienia w tej grupie chorych były przeprowadzane w jak najwcześniejszych stadiach choroby. Dzięki temu można uzyskać ich jak najlepszy efekt. Jest to ważne szczególnie w przypadku osób w podeszłym wieku, u których występują liczne choroby towarzyszące (astma oskrzelowa, przewlekła obturacyjna choroba płuc (POCHP), cukrzyca, niewydolność serca) oraz tych, u których rozważa się kwalifikację do transplantacji nerki i związaną z nią konieczność stosowania przewlekłego leczenia immunosupresyjnego. Zalecenie to dotyczy zwłaszcza sczepienia przeciwko wirusowemu zapaleniu wątroby typu B. Jeśli jednak nie udało się zaszczepić z wyprzedzeniem, należy niezwłocznie uzupełnić szczepienia już po rozpoczęciu dializoterapii. Inne szczepienia zalecane to: sezonowe szczepienie przeciwko grypie i u wybranej grupy osób - przeciwko pneumokokom.